轉(zhuǎn)座子整合穩(wěn)定細(xì)胞株
產(chǎn)品描述
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案例展示
▏ 名字定義
轉(zhuǎn)座因子（Transposable element，簡稱TE），又稱“跳躍基因”，是指從基因組的一個位置移動到另一個位置的DNA序列。這類因子最早由遺傳學(xué)家芭芭拉·麥克林托克于50多年前發(fā)現(xiàn)。起初，生物學(xué)家對麥克林托克的發(fā)現(xiàn)持懷疑態(tài)度。然而，在接下來的幾十年里，人們逐漸發(fā)現(xiàn)，TE不僅會“跳躍”，而且?guī)缀醮嬖谟谒猩矬w（包括原核生物和真核生物）中，而且通常數(shù)量巨大。例如，TE約占人類基因組的50%，占玉米基因組的90%。
▏ 轉(zhuǎn)座子類型
根據(jù)轉(zhuǎn)座機制，轉(zhuǎn)座因子可分為兩類：
1.I類轉(zhuǎn)座因子（也稱為逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子）
2.II類轉(zhuǎn)座因子（也稱為DNA轉(zhuǎn)座子）。
圖1：不同真核生物基因組中逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子和DNA轉(zhuǎn)座子的相對數(shù)量。
該圖顯示了DNA轉(zhuǎn)座子和逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子在各物種中占轉(zhuǎn)座因子總數(shù)的百分比。（Sc：釀酒酵母；Sp：粟酒裂殖酵母；Hs：智人；Mm：小家鼠；Os：水稻；Ce：秀麗隱桿線蟲；Dm：果蠅；Ag：岡比亞按蚊（瘧蚊）；Aa：埃及伊蚊（黃熱病蚊）；Eh：溶組織內(nèi)阿米巴；Ei：入侵內(nèi)阿米巴；Tv：陰道毛滴蟲。）
I類轉(zhuǎn)座因子（TE）：逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子
I類轉(zhuǎn)座子也稱為逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子。它們通過“復(fù)制粘貼Ctrl C+V”機制進(jìn)行轉(zhuǎn)座（圖1）。它們首先將自身復(fù)制為RNA轉(zhuǎn)錄本，然后依靠逆轉(zhuǎn)錄酶逆轉(zhuǎn)錄回DNA，最終插入新的靶位。這與逆轉(zhuǎn)錄病毒（如HIV）的復(fù)制方式類似。
I類轉(zhuǎn)座子不編碼轉(zhuǎn)座酶。I類TE被認(rèn)為是具有復(fù)制性的，因為它們每次跳躍都會復(fù)制自身。這增加了TE的拷貝數(shù)量，同時也增加了宿主基因組的大小。
I類轉(zhuǎn)座子有兩種類型：具有長末端重復(fù)序列（LTR）的轉(zhuǎn)座子和不具有長末端重復(fù)序列（非LTR轉(zhuǎn)座子）。LTR逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子的結(jié)構(gòu)和復(fù)制機制與逆轉(zhuǎn)錄病毒相似。它們包含兩個基因： gag和pol。pol多聚蛋白編碼LTR逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)座所需的逆轉(zhuǎn)錄酶和整合酶。非LTR逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子包含兩個開放閱讀框（ORF），通常以poly(A)結(jié)尾。ORF2編碼內(nèi)切酶和逆轉(zhuǎn)錄酶活性。
圖 1：逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)座概述。逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子通過“復(fù)制粘貼Ctrl C+V”機制進(jìn)行移動。
II類TE：DNA轉(zhuǎn)座子
II類轉(zhuǎn)座子也稱為DNA轉(zhuǎn)座子，因為它們在移動時不需要RNA中介。大多數(shù)II類轉(zhuǎn)座子具有非復(fù)制性的“剪切粘貼Ctrl X+V”轉(zhuǎn)座機制：它們首先從一個位置切除自身，然后插入到另一個位置（圖2）。II類轉(zhuǎn)座子的兩端均有長末端重復(fù)序列（LTR）。
